Axe fédérateur II

Coordinateurs : Daniel BIRNBAUM, Dominique FIGARELLA BRANGER

Le programme de génomique descriptive du Canceropôle PACA initié en 2003 a contribué au repositionnement national dans le domaine de l'analyse de l'hétérogénéité des tumeurs.
Le Canceropôle a en effet permis de mieux organiser les centres de ressources biologiques, d'optimiser les plateformes technologiques dédié à  l'analyse du génôme et de développer des programmes de recherche compétitifs.

• Organisation des CRB à  l'échelle régionale (voir rubrique Ressources biologiques) et nationale pour les programmes à  grande échelle
• Optimisation et mutualisation des plateformes (voir rubrique ressources technologiques)

Programmes en cours

1. Analyse génomique du cancer du sein (ACI 2004 et PL 2005)
2. Analyse génomique des tumeurs du système nerveux central (RS Gliomes 2005)
3. Leucémies et lymphomes (PL 2006)
4. Cancers digestifs
5. Sarcomes
6. Cancers de la tête et du cou

Principaux objectifs 2007-2010 de l'axe de génomique descriptive

1. Intégration de nouveaux partenaires dans les projets, notamment dans les domaines de la bioinformatique, des cellules souches et de la génétique
2. Renforcement des collaborations nationales (inter-canceropôles) pour les programmes nécessitant une expansion en nombre de tumeurs et d'expertises
3. Exploration moléculaire de nouvelles pathologies : prostate, ovaire, pancréas, tumeurs endocrines, thyroïde.
4. Expansion et validation des informations obtenues par l'approche génomique
   1. Développement de l'outil bioinformatique : méta-analyse, data mining
   2. Validation des gènes-candidats sur des modèles animaux et cellulaires et par des tests fonctionnels
   3. Validation clinique de profils d'expression génique et protéique
   4. Développement de programmes sur les gènes de susceptibilité (oncogénomique)
   5. Développement de programmes sur la biologie des cellules souches
   6. Transfert vers la clinique et la recherche cognitive